Au bout de deux des bras du Chiosto se trouve l'entrée du Museo dell'Opera Francescana. Divisé en quatre salles, il a été ouvert au public en 1995 et conserve quelques trésors du complexe monastique qui a échappé aux bombardements de 1943.

L'itinéraire se poursuit dans la zone archéologique où se trouvent les vestiges d'un bain romain découverts lors des travaux de restauration après la Seconde Guerre mondiale.